Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC4P0CG21 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms