Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms