Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPBP07199 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPBP07199 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPBP07199 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPBP07199 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPBP07199 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPBP07199 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CENPBP07199 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPBP07199 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPBP07199 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPBP07199 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPBP07199 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPBP07199 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPBP07199 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPBP07199 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPBP07199 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPBP07199 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CENPBP07199 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CENPBP07199 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CENPBP07199 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CENPBP07199 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CENPBP07199 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CENPBP07199 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CENPBP07199 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CENPBP07199 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CENPBP07199 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CENPBP07199 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CENPBP07199 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CENPBP07199 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CENPBP07199 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPBP07199 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPBP07199 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPBP07199 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPBP07199 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPBP07199 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPBP07199 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPBP07199 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPBP07199 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPBP07199 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPBP07199 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPBP07199 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPBP07199 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CENPBP07199 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPBP07199 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPBP07199 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPBP07199 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPBP07199 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPBP07199 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPBP07199 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPBP07199 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPBP07199 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPBP07199 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CENPBP07199 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPBP07199 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPBP07199 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPBP07199 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPBP07199 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPBP07199 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPBP07199 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPBP07199 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPBP07199 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPBP07199 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPBP07199 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPBP07199 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CENPBP07199 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CENPBP07199 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CENPBP07199 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPBP07199 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPBP07199 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CENPBP07199 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms