Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4AP04350 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms