Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL2A1P02458 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL2A1P02458 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms