Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCAP01258 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALCAP01258 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCAP01258 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALCAP01258 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCAP01258 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCAP01258 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCAP01258 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCAP01258 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCAP01258 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCAP01258 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCAP01258 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCAP01258 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCAP01258 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCAP01258 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCAP01258 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCAP01258 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALCAP01258 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCAP01258 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCAP01258 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCAP01258 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCAP01258 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCAP01258 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCAP01258 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCAP01258 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCAP01258 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCAP01258 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCAP01258 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCAP01258 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCAP01258 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCAP01258 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCAP01258 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCAP01258 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCAP01258 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCAP01258 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCAP01258 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCAP01258 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCAP01258 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCAP01258 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCAP01258 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCAP01258 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCAP01258 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCAP01258 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCAP01258 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCAP01258 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCAP01258 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCAP01258 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCAP01258 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCAP01258 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms