Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB6O95452 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB6O95452 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB6O95452 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB6O95452 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB6O95452 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB6O95452 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB6O95452 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB6O95452 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB6O95452 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB6O95452 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB6O95452 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB6O95452 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB6O95452 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB6O95452 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB6O95452 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB6O95452 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB6O95452 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB6O95452 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB6O95452 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB6O95452 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB6O95452 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJB6O95452 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB6O95452 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB6O95452 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB6O95452 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms