Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM63AO94886 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM63AO94886 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM63AO94886 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM63AO94886 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM63AO94886 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM63AO94886 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM63AO94886 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM63AO94886 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM63AO94886 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM63AO94886 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM63AO94886 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM63AO94886 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM63AO94886 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM63AO94886 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM63AO94886 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM63AO94886 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM63AO94886 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM63AO94886 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM63AO94886 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM63AO94886 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM63AO94886 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM63AO94886 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM63AO94886 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM63AO94886 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM63AO94886 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM63AO94886 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM63AO94886 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM63AO94886 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM63AO94886 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM63AO94886 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms