Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPHP4O75161 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPHP4O75161 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms