Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RAB11FIP3O75154 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP3O75154 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms