Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGSF3O75054 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms