Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms