Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA2O43464 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms