Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SART1O43290 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SART1O43290 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SART1O43290 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SART1O43290 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SART1O43290 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SART1O43290 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SART1O43290 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SART1O43290 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SART1O43290 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SART1O43290 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SART1O43290 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SART1O43290 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SART1O43290 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SART1O43290 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SART1O43290 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SART1O43290 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SART1O43290 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SART1O43290 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SART1O43290 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SART1O43290 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SART1O43290 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SART1O43290 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SART1O43290 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SART1O43290 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SART1O43290 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SART1O43290 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SART1O43290 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SART1O43290 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SART1O43290 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SART1O43290 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SART1O43290 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SART1O43290 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SART1O43290 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SART1O43290 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SART1O43290 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SART1O43290 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SART1O43290 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SART1O43290 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SART1O43290 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SART1O43290 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms