Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM6AO15550 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM6AO15550 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM6AO15550 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms