Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF10O15013 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF10O15013 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF10O15013 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF10O15013 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF10O15013 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF10O15013 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF10O15013 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF10O15013 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF10O15013 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF10O15013 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF10O15013 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ARHGEF10O15013 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
ARHGEF10O15013 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF10O15013 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF10O15013 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF10O15013 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF10O15013 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF10O15013 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF10O15013 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF10O15013 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF10O15013 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF10O15013 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF10O15013 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF10O15013 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF10O15013 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF10O15013 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF10O15013 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF10O15013 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms