Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIP1O00291 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIP1O00291 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIP1O00291 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIP1O00291 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIP1O00291 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIP1O00291 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIP1O00291 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIP1O00291 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIP1O00291 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HIP1O00291 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIP1O00291 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIP1O00291 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIP1O00291 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIP1O00291 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HIP1O00291 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HIP1O00291 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HIP1O00291 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HIP1O00291 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIP1O00291 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIP1O00291 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIP1O00291 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIP1O00291 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIP1O00291 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIP1O00291 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIP1O00291 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIP1O00291 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIP1O00291 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIP1O00291 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIP1O00291 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIP1O00291 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIP1O00291 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIP1O00291 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIP1O00291 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIP1O00291 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIP1O00291 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIP1O00291 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIP1O00291 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIP1O00291 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIP1O00291 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIP1O00291 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIP1O00291 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIP1O00291 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIP1O00291 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIP1O00291 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIP1O00291 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIP1O00291 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIP1O00291 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HIP1O00291 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIP1O00291 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HIP1O00291 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIP1O00291 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIP1O00291 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIP1O00291 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIP1O00291 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIP1O00291 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIP1O00291 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIP1O00291 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIP1O00291 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIP1O00291 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIP1O00291 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIP1O00291 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIP1O00291 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIP1O00291 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIP1O00291 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIP1O00291 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIP1O00291 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIP1O00291 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIP1O00291 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIP1O00291 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIP1O00291 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIP1O00291 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIP1O00291 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HIP1O00291 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HIP1O00291 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIP1O00291 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms