Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4E1Z4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4E1Z4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E1Z4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E1Z4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4E1Z4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4E1Z4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4E1Z4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4E1Z4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
B4E1Z4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4E1Z4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4E1Z4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4E1Z4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4E1Z4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4E1Z4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
B4E1Z4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B4E1Z4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B4E1Z4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B4E1Z4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B4E1Z4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B4E1Z4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
B4E1Z4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B4E1Z4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
B4E1Z4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E1Z4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4E1Z4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4E1Z4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4E1Z4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4E1Z4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4E1Z4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4E1Z4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
B4E1Z4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4E1Z4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4E1Z4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
B4E1Z4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
B4E1Z4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
B4E1Z4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
B4E1Z4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
B4E1Z4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
B4E1Z4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
B4E1Z4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
B4E1Z4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
B4E1Z4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
B4E1Z4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
B4E1Z4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
B4E1Z4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
B4E1Z4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4E1Z4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4E1Z4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4E1Z4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
B4E1Z4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4E1Z4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4E1Z4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4E1Z4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4E1Z4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms