Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms