Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC85CA6NKD9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85CA6NKD9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms