Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP73A6NFT4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms