Protein–RNA interactions for Protein: A6NC62

RBAKDN, Putative RBAK downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAKDNA6NC62 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBAKDNA6NC62 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms