Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
EME2A4GXA9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EME2A4GXA9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms