Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms