Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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ARL2-SNX15V9GYD0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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ARL2-SNX15V9GYD0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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