Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms