Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms