Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM50BQ9Y247 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms