Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms