Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP18Q9UMW8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP18Q9UMW8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms