Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD4Q9ULV1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD4Q9ULV1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms