Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRIP2Q9ULQ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRIP2Q9ULQ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms