Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH9Q9ULB4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH9Q9ULB4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms