Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA3Q9UL41 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms