Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RCAN3Q9UKA8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms