Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBE1Q9UJT0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBE1Q9UJT0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms