Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIMS3Q9UJD0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms