Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRAQ9UJ68 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRAQ9UJ68 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRAQ9UJ68 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRAQ9UJ68 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRAQ9UJ68 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRAQ9UJ68 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRAQ9UJ68 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRAQ9UJ68 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRAQ9UJ68 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRAQ9UJ68 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRAQ9UJ68 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRAQ9UJ68 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRAQ9UJ68 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRAQ9UJ68 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms