Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPC1L1Q9UHC9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms