Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms