Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms