Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRP2BPQ9P2M1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP2BPQ9P2M1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms