Protein–RNA interactions for Protein: Q9P202

WHRN, Whirlin, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHRNQ9P202 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WHRNQ9P202 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WHRNQ9P202 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WHRNQ9P202 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WHRNQ9P202 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WHRNQ9P202 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WHRNQ9P202 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WHRNQ9P202 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WHRNQ9P202 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
WHRNQ9P202 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WHRNQ9P202 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
WHRNQ9P202 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms