Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CALCOCO1Q9P1Z2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms