Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NINJ2Q9NZG7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NINJ2Q9NZG7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms