Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRN3Q9NYV6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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