Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK12Q9NYV4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms