Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDAP2Q9NXN4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms