Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM28Q9NW13 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms