Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L1Q9NU39 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms